Анализ повторов HTT

Исследование считает последовательные CAG-тройки в гене HTT; число повторов используют при оценке наследственной болезни Гентингтона.

Что показывает повторы HTT

Участок HTT содержит повторяющуюся последовательность CAG. При его расширении меняются свойства белка хантингтина. По рекомендации EMQN/CMGS (2013), лабораторный ответ должен сообщать число повторов и ограничения измерения, особенно около интервалов с неоднозначным прогнозом. КДЛ явно указывает подсчёт CAG; два других названия описывают генодиагностику той же болезни по венозной крови. Такой анализ отличается от секвенирования всего гена: решающим параметром здесь служит длина повтора.

Как называется в бланках разных лабораторий

ЛабораторияНазваниеКод
ГемотестГенодиагностика болезни Гентингтона (НТТ)GNP112
KDLГенодиагностика болезни Гентингтона (оценка числа CAG-повторов в гене НТТ)22.1.D30
СитилабГенодиагностика хореи Гентингтона96-10-075

Выше нормы: что это может значить

Длинный повтор может подтверждать генетическую причину характерных двигательных и когнитивных изменений. Число не является календарём начала симптомов: проявления и семейный контекст оценивают отдельно.

Ниже нормы: что это может значить

Повтор в обычном диапазоне не поддерживает болезнь, связанную с расширением HTT. Если симптомы есть, их причины ищут клинически; нормальная длина участка не описывает весь мозг и не заменяет неврологическое обследование.

Как сдавать

Вода перед взятием крови не влияет на число CAG-повторов в ДНК.

Берут венозную кровь для выделения ДНК. Предиктивное тестирование человека без симптомов требует отдельного разговора о возможных последствиях ответа для него и семьи.

Откуда берут кровь

Проба должна быть подписана и сопоставлена с конкретным человеком: ошибку идентификации нельзя исправить интерпретацией числа повторов.

Срок, биоматериал, метод, код

ЛабораторияСрокБиоматериалМетодКод
Гемотест14 днейВенозная кровь-GNP112
KDL11 днейКровь с ЭДТА-22.1.D30
Ситилаб13 календарных днейВенозная кровьПолимеразная цепная реакция (ПЦР); Фрагментный анализ ДНК96-10-075

Где сдать

ЛабораторияКодБиоматериал или локусМетодТип результатаСрокНорма
ГемотестGNP112Венозная кровь-по бланку14 днейпо бланку
KDL22.1.D30Кровь с ЭДТА-по бланку11 днейпо бланку
Ситилаб96-10-075Венозная кровьПолимеразная цепная реакция (ПЦР); Фрагментный анализ ДНКпо бланку13 календарных днейпо бланку

Название и условия варианта сверяйте в карточке лаборатории; референс конкретного бланка имеет приоритет.

Карточки вариантов в лабораториях

Частые вопросы

Меняется ли число CAG-повторов после еды

Нет, пища не переписывает исследуемую последовательность ДНК.

Можно ли по числу назвать дату начала болезни

Нет, этот показатель не даёт точного индивидуального срока появления проявлений.

Нужен ли результат родственника

Семейные данные помогают объяснить цель проверки, особенно при тестировании до симптомов.

Почему в бланке бывает диапазон

Около границ интерпретации методическая неопределённость и неполная пенетрантность требуют пояснения специалиста.

Источники

  1. . Best practice guidelines for the molecular genetic testing of Huntington disease ()